Набор для секвенирования ДНК со стадией ПЦР, PCR Seqiencing Kit, Oxford Nanopore Technologies, SQK-PSK004
Предлагаем к покупке Набор для секвенирования ДНК со стадией ПЦР, PCR Seqiencing Kit, Oxford Nanopore Technologies, SQK-PSK004. На рынке медицинского оборудования компания ЛидерМед Групп уже более 10 лет! С нами сотрудничают как крупные государственные учреждения, так и частные международные клиники. Среди наших поставщиков ведущие производители медоборудования с многолетней историей, опытом и надежной репутацией. Вся продукция лицензирована и сертифицирована в соответствии с установленными требованиями.
Набор предназначен для получения сиквенсной библиотеки из геномной ДНК в тех случаях, когда количество стартового материала ограничено. С помощью набора PCR Sequencing Kitможно:
- работать с небольшим исходным количеством ДНК;
- контролировать длину секвенируемых фрагментов;
- оптимизировать эксперимент для максимальной производительности;
- проводить таргетное секвенирование.
Особенности набора:
время пробоподготовки | от 60 минут + ПЦР |
требуемое количество ДНК | до 100 нг геномной ДНК |
необходимость ПЦР | да |
фрагментация ДНК | опциональная |
длина рида | зависит от длины ампликона |
производительность | 3 гигабазы и более за 6 часов, 8 гигабаз и более за 48 часов |
совместимые протоколы | PCR Sequencing |
Four Primer (Nested) PCR Sequencing* | |
мультиплексирование | до 12 образцов, с PCR Barcoding Kit |
количество библиотек | 6 |
* Полные протоколы доступны на сайтеwww.nanoporetech.comдля зарегистрированных пользователей-участниковNanopore Community.
Пробоподготовка заключается в опциональной фрагментации ДНК с последующей достройкой концов до тупых и присоединением 3’-dA. К 3’-dA лигируются олигонуклеотиды, содержащие сайты связывания ПЦР-праймеров. ДНК амплифицируется, и к ампликонам присоединяются сиквенсные адаптеры.
Стадия ПЦР зависит от исходного количества ДНК и желаемой длины ампликонов. Рекомендуемый протокол ПЦР рассчитан на 100 нг исходной ДНК.
Длина рида составляет в среднем около 2 килобаз и зависит не столько от процессивности Taq-полимеразы, сколько от особенностей пробоподготовки. Но при этом максимальная длина рида выше, чем при использовании набораRapid PCR Barcoding Kitи может достигать 10 килобаз.
Пользователь также может использовать метод ПЦР с 2 парами праймеров (nested PCR); при этом одна пара праймеров — пользовательские праймеры к определённой последовательности ДНК, а вторая — бар-кодированные праймеры из набора. 5’-концы пользовательских праймеров должны быть комплементарны 3’-концам бар-кодированных праймеров.
Набор позволяет работать с ДНК, содержащей примеси, которые снижают эффективность получения библиотеки. Это происходит благодаря стадии ПЦР. Но необходимо учитывать, что амплификация разных фрагментов может идти с разной эффективностью.
Если исходное количество ДНК менее 1 пг, рекомендуется полногеномная амплификация.
В составPCR Sequencing Kitтакже входит наборFlow Cell Priming Kitдля загрузки библиотеки в поточную ячейку.
Условия хранения: -20 °С.
Дополнительные расходные материалы и реактивы:
- магнитные частицыAgencourt AMPure XP(Beckman Coulter);
- набор для достройки концов ДНКNEBNext End repair / dA-tailing Module(New England BiolabsE7546);
- ДНК-лигазаNEB Blunt/TA Ligase Master Mix(New England BiolabsM0367);
- 1,5 мл пробирки типа Эппендорф с низкой адгезивностьюDNA LoBind(Eppendorf30108051);
- 0,2 мл тонкостенные пробирки для ПЦР (Thermo FSAB0620);
- вода, не содержащая нуклеаз (Thermo FSR0581);
- мастер-микс для ПЦРLongAmp Taq 2X(New England BiolabsM0287);
- свежеприготовленный 70% этанол;
- буферный раствор Tрис-HCl 10 мМ рН 8.0 с 50 мМ NaCl.
Опционально:
- экзонуклеаза I (New England BiolabsM0293);
- пробирки для фрагментации ДНКCovaris g-TUBE.
Дополнительное оборудование:
- настольная микроцентрифуга (например,Eppendorf5452000018);
- вортекс (например,BiosanBS-010203-AAG);
- магнитный штатив (Диаэм3336);
- ротационный перемешиватель (например,ElmiRM1L);
- амплификатор;
- набор автоматических пипеток переменного объёма — от 0,5 до 10 мкл (например,Eppendorf3120000020), от 2 до 20 мкл (например,Eppendorf3120000038), от 10 до 100 мкл (например,Eppendorf3120000046), от 20 до 200 мкл (например,Eppendorf3120000054) и от 100 до 1000 мкл (например,Eppendorf3120000062);
- наконечники с фильтром к автоматическим пипеткам;
- таймер (например, TR118OS).
Опционально:
- флуориметрQubit(Thermo FSQ33227) или аналогичный;
- система для фрагментного анализа (например,Qsep 100);
- наноспектрофотометр (например, NanoDrop 2000C).
Вы можете купить Набор для секвенирования ДНК со стадией ПЦР, PCR Seqiencing Kit, Oxford Nanopore Technologies, SQK-PSK004 уже сегодня, связавшись с персональным менеджером по указанному номеру телефона или через почту. Вас обязательно проконсультируют по любым выбранным товарным позициям и помогут подобрать оптимальный вариант. Также рады сообщить, что доставка осуществляется по территории всей России и ближнего зарубежья. При необходимости опционально доступна поставка и установка дополнительного оборудования. После покупки предоставляется сервисное и гарантийное обслуживания.
Гарантия
По вопросам гарантии и сервиса обращайтесь по адресу lider@biomedgroup.ru. Подробная информация на странице Гарантия.
Доставка
По вопросам, связанным с оплаченными счетами на отгрузку и доставку продукции в Перми, РФ и СНГ, звоните по общему телефону или пишите в отдел сопровождения заказов: lider@biomedgroup.ru. Подробная информация на странице Доставка.